تتولى هذه الشعبة توفير البرامجيات الامنية لحماية البرامج المعدة من قبل شعبة تطوير الانظمة وشعبة البرمجة ، ومتابعة التطورات الحاصلة في مجال امن البرامجيات ، وتطبيق التقنيات الخاصة بالحماية الامنية للبرامجيات والتطبيقات من الاختراق .